Брейн-марафон представляет собой игровую форму интеллектуального состязания команд.

Ведущий зачитывает вопрос. При окончании чтения вопроса включается брейн-система и подается команда «Время». После светового или звукового сигнала, свидетельствующего о начале обсуждения, команда может нажать на кнопку. Если первая команда ответила неправильно, вторая команда продолжает обдумывание вопроса и, в свою очередь, сообщают о своей готовности отвечать нажатием на кнопку. Команда имеет право не отвечать на вопрос. На обдумывание вопроса отводится минута, однако, после ответа первой команды или фальстарта, на обдумывание дается 20 секунд. Ответ на вопрос должен быть кратким.

За каждый правильный ответ команда получает 1 балл. По итогам розыгрыша 5 вопросов команда, набравшая большее количество баллов, получает 3 очка в турнирную таблицу. Команда, набравшая меньшее количество баллов, получает 1 очко в турнирную таблицу.